Como CONAP son de carácter regional, tienen la sede de la institución en la cabecera departamental de Jutiapa, tienen 26 áreas protegidas a su cargo, incluyendo la parte alta de Jalapa con el tema de pinabete, 4 áreas protegidas que son zonas de veda definitiva según decreto del año 1956, y el resto de áreas protegidas que están en Jutiapa, según lo dio a conocer Luis Enrique Martínez director regional de CONAP sur oriente.
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En la parte media con el bosque seco, también en muchas zonas de veda definitiva, reservas naturales privadas, áreas de uso múltiple y trabajos en el sector costero marino, desde la parte de La Barrona, Moyuta, Jutiapa hasta finalizar con El Conacaste que pertenece a Iztapa del departamento de Escuintla.
Hay muchas actividades que se realizan con el personal técnico y de guarda recursos asignado a estas áreas específicamente en el departamento de Jalapa, tienen a personal de guarda recursos para vigilar en las áreas de volcán Alzatate y volcán Jumay están viendo en la temporada época seca el tema de los incendios forestales, desde luego la Municipalidad y CONRED del departamento de Jalapa, pues son su mano derecha en el tema de incendios forestales para hacer acciones de prevención y también actividades o dinámicas en el tema de control de incendios forestales.
Hay actividades que se están realizando de control y vigilancia con Policía Nacional Civil y con los elementos de DIPRONA para ver los temas de tráfico ilegal de flora y fauna, todas aquellas ilegalidades que ocurren y que se trasladan en carreteras del departamento, como los otros dos departamentos de la región sur oriente.
